Ngày 22 tháng 10 năm 2019, Cơ quan điều tra hình sự Bộ Quốc phòng phối hợp với Viện Kiểm sát Quân sự Trung ương tống đạt quyết định khởi tố bị can và lệnh cấm đi khỏi nơi cư trú đối với Đô đốc Nguyễn Văn Hiến, nguyên Thứ trưởng Bộ Quốc phòng, nguyên Tư lệnh Quân chủng Hải quân, về tội Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng quy định tại khoản 3 điều 360 Bộ luật Hình sự. Ông bị cáo buộc có liên quan trách nhiệm trong vụ án Đinh Ngọc Hệ, tức "Út Trọc", Bùi Văn Nga và đồng phạm, thực hiện không đúng thẩm quyền, vi phạm các quy định pháp luật về quản lý, sử dụng đất đai, đầu tư xây dựng đối với 10 khu đất quốc phòng. Trong cùng vụ việc còn có Chuẩn Đô đốc Lê Văn Đạo và Phó Đô đốc Nguyễn Văn Tình. Hai sỹ quan cấp cao này bị kỷ luật với hình thức cảnh cáo lần lượt trong tháng 5 và tháng 6 năm 2019.[11]